Temiz ve sağlıklı su Bitki, yem artıkları ve metabolizma ürünleri akvaryum suyunun kalitesini bozar. Akvaryumdaki balıkların ve bitkilerin sağlığının desteklenmesi açısından su kalitesinin iyi olması gerekir. Bu, değişik filtreler ve farklı filtre materyalleri ile elde edilir. Filtreler akvaryum suyunu emer ve kirleri ve artıkları filtre materyalinden geçirerek sudan ayırır.