Die Wassertemperatur in Aquarien hat für Tiere und Pflanzen eine entscheidende Bedeutung und sollte daher unbedingt überwacht werden. Die meisten tropischen Zierfische fühlen sich bei Temperaturen zwischen 24 und 26 °C am wohlsten. Es gibt aber auch Fische, die niedrigere Temperaturen bevorzugen. Der Diskusbuntbarsch gehört zu den Fischen, die eher höhere Temperaturen zwischen 27 und 29 °C als ideal empfinden. Axolotl und viele Süßwassergarnelen bevorzugen eher kühlere Temperaturen.
Mit Hilfe von Regelheizern (JBL PROTEMP s oder JBL PROTEMP e) kann die Wassertemperatur erhöht und mit Hilfe von Kühlern (JBL Cooler) gesenkt werden.