La temperatura del agua en los acuarios es de vital importancia para los animales y las plantas, por lo que es imprescindible controlarla. Para la mayoría de peces ornamentales tropicales, la temperatura más adecuada es de entre 24 y 26 °C. Pero también hay peces que prefieren temperaturas más bajas. El pez disco se cuenta entre los peces para los que unas temperaturas más bien altas de entre 27 y 29 °C resultan ideales. Los ajolotes y muchas gambas de agua dulce prefieren temperaturas más bien frías.
Empleando un calentador autorregulador (JBL PROTEMP s o JBL PROTEMP e) se puede aumentar la temperatura del agua, y con unos ventiladores (JBL Cooler), se puede reducir.