Filtre materyalleri çeşitli amaçlarla kullanılır: Askıda katı maddeleri sudan filtre ederler (mekanik filtreleme), zararlı maddeleri bozunduran bakteriler için kolonileşme alanı yaratırlar (biyolojik filtreleme) ya da sudaki zararlı maddeleri giderirler (kimyasal/emici filtre materyalleri). Mekanik filtre maddeleri belli bir zaman sonra doğal olarak biyolojik filtre materyaline dönüşür. İnce filtre materyalleri önde yer alırsa çok çabuk tıkandığından, filtrede her zaman kabadan inceye doğru filtreleme yapılmalıdır. İlk filtre kademesi için kaba filtre süngeri veya filtre seramiği (JBL Cermec) idealdir. JBL Sintomec ve JBL Micromec biyolojik filtreleme bağlamında zararlı maddeleri bozunduran bakteriler için en büyük yüzey alanını sunar. Sudaki renklenmeleri ve ilaç artıklarını filtrelemek için aktif kömür (JBL Carbomec activ ve Carbomec ultra) kullanılır. Yosun oluşumunu destekleyen nitratları filtrelemek için JBL NitratEx ve JBL BioNitrat Ex mevcuttur. JBL PhosEx Ultra yosun gelişimini destekleyen fosfata karşı etkilidir. Silicat Ex diyatom gelişimini destekleyen silisik asite karşı etkilidir.
Nitratı yok etmek için 2 alternatif:
JBL NitratEx: Burada söz konusu olan, yosun gelişimini destekleyen nitratı (NO3) sudan emen ve zararsız klorürle değiştiren bir değiştirici reçinedir. Bu, beklemeden, hızlı bir şekilde ve doğrudan akış içerisinde gerçekleşir. Böylece, musluk suyundaki nitrat da akvaryuma ulaşmadan önce yok edilebilir.
JBL BioNitratEx: Üzerinde bakterilerin belli bir bekleme süresinden sonra kolonileştiği ve sonrasında nitratı herhangi bir “yan etki” olmaksızın biyolojik olarak bozundurduğu biyolojik bir filtre materyalidir. Bakteriler etkin bir nitrat bozunumu için filtre materyalinde mevcut bir karbon kaynağına (besin) ihtiyaç duyar. Bu nedenle JBL BioNitratEX topları zaman içerisinde küçülerek tamamen yok olur. Ancak o zaman yenilenmeleri gerekir.