Teplota vody v akváriích má pro živočichy a rostliny zásadní význam, a proto by měla být sledována. Většina tropických okrasných ryb se cítí nejlépe při teplotě 24 až 26 °C. Některé ryby však dávají přednost nižším teplotám. Mezi ryby, pro které jsou ideální vyšší teploty mezi 27 a 29 °C, patří například terčovec. Axolotl a mnoho sladkovodních krevet dává přednost nižším teplotám. Teplotu vody lze zvýšit pomocí regulačních ohřívačů (JBL PROTEMP s nebo JBL PROTEMP e) a snížit pomocí chladičů (JBL Cooler).