Materiały filtracyjne służą do różnych celów: Filtrują substancje zawieszone w wodzie (filtracja mechaniczna), zapewniają przestrzeń do osiedlania się bakterii rozkładających szkodliwe substancje (filtracja biologiczna) lub pobierają szkodliwe substancje z wody (chemiczne/absorbujące materiały filtracyjne). W filtrze zawsze filtruje się w kolejności od dużych do drobnych zanieczyszczeń, ponieważ gęsty materiał filtracyjny na początku za szybko zapycha się. Idealna do pierwszego poziomu filtracji jest gąbka filtracyjna o dużych porach lub ceramika filtracyjna (JBL Cermec). JBL Sintomec i JBL Micromec zapewniają do filtracji biologicznej największą powierzchnię dla bakterii rozkładających szkodliwe substancje. Do filtrowania zabarwień i pozostałości lekarstw jest węgiel aktywny (JBL Carbomec activ/Carbomec ultra). Do filtrowania azotanów do dyspozycji są JBL NitratEx i JBL BioNitrat Ex. JBL PhosEx Ultra pomaga w zwalczaniu fosforanów sprzyjających rozwojowi glonów. Silicat Ex pomaga przeciw kwasowi krzemowemu sprzyjającemu rozwojowi okrzemek. Jakość materiału filtracyjnego określa zasadniczo skuteczność filtra akwarystycznego! Większość filtrów akwarystycznych jest już wyposażona w gąbki jako materiał filtracyjny. Gąbki mają już dosyć dużą powierzchnię, którą z biegiem czasu zasiedlają pożyteczne baterie rozkładające szkodliwe substancje. Rurki ceramiczne są idealnym materiałem do filtracji wstępnej, ponieważ dzięki ich kształtowi rurek dobrze zatrzymują brud, ale nie zapychają się tak szybko, jak np. gąbki! Można je szybko przepłukać pod bieżącą wodą i są wtedy natychmiast gotowe do ponownego użycia. Pożyteczne bakterie rozkładające szkodliwe substancje mogą się osiedlać zarówno na zewnątrz i wewnątrz rurek ceramicznych. Powierzchnia rurek ceramicznych jest jednakże wyraźnie mniejsza niż rurek ze szkła spiekanego jak w JBL SintoMec. Dlatego zalecamy stosowanie rurek ceramicznych jako materiału do filtracji wstępnej i rurek ze szkła spiekanego jako biologicznego głównego materiału filtracyjnego, nawet jeżeli obydwa rodzaje rurek spełniają obydwie funkcje.