La temperatura dell'acqua d'acquario riveste un'importanza determinante per gli animali e le piante e quindi va assolutamente monitorata. La maggior parte dei pesci ornamentali tropicali si sente bene a temperature tra 24 e 26 °C. Ci sono però anche pesci che prediligono temperature più basse. Il pesce disco invece fa parte dei pesci che si sentono a loro agio a temperature più alte. Gli Axolotl e molti gamberi d'acqua dolce preferiscono piuttosto temperature più basse.
Mediante termoriscaldatori (JBL PROTEMP s o JBL PROTEMP e) è possibile alzare la temperatura dell'acqua e con refrigeratori (JBL Cooler) abbassarla.