De watertemperatuur in aquariums is van doorslaggevend belang voor dieren en planten en moet daarom absoluut in de gaten worden gehouden. De meeste tropische siervissen voelen zich prima bij temperaturen tussen 24 en 26 °C. Maar er zijn natuurlijk ook vissen die de voorkeur geven aan lagere temperaturen. De discus cichlide behoort dan weer tot die vissen die hogere temperaturen, tussen 27 en 29 °C, ideaal vinden. Axolotl en veel zoetwatergarnalen houden eerder van koelere temperaturen.
Met behulp van regelbare verwarmingen (JBL PROTEMP s of JBL PROTEMP e) kan de watertemperatuur naar wens verhoogd worden en met behulp van een koeler (JBL Cooler) kan die verlaagd worden.