Filtrační materiály slouží k různým účelům: jsou určeny k odfiltrování plovoucích látek z vody (mechanická filtrace), jsou určeny k vytvoření prostoru k usídlení bakterií rozkládajících znečišťující látky (biologická filtrace) nebo jsou určeny k odstranění škodlivých látek z vody (chemické/adsorpční filtrační materiály). Mechanické filtrační materiály se samozřejmě po určité době stávají biologickými filtračními materiály.
Ve filtru byste měli vždy filtrovat od hrubých po jemné částice, protože jemný filtrační materiál se na začátku příliš rychle ucpává. Hrubá filtrační houba nebo filtrační keramika (JBL Cermec) je ideální pro první stupeň filtru. JBL Sintomec a JBL Micromec nabízejí pro biologickou filtraci největší plochu pro bakterie, které rozkládají škodlivé látky. K filtrování zbarvení a zbytků léků je k dispozici aktivní uhlí (JBL Carbomec activ/Carbomec ultra). K dispozici jsou filtry JBL NitratEx a JBL BioNitrat Ex, které filtrují dusičnany. JBL PhosEx Ultra pomáhá proti fosfátům podporujícím řasy. Silicat Ex pomáhá proti kyselině křemičité, která podporuje tvorbu diatomie.
2 alternativy odstraňování dusičnanů:
JBL NitratEx: Jedná se o výměnnou pryskyřici, která z vody extrahuje dusičnany (NO3) podporující růst řas a nahrazuje je neškodným chloridem. To probíhá rychle a v přímém průtoku bez čekání. Tímto způsobem lze také odstranit dusičnany z vody z vodovodu dřívě, než se dostanou do akvária.
JBL BioNitratEx: Je biologický filtrační materiál, na kterém se po určité čekací době usadí bakterie a následně biologicky rozloží dusičnany bez jakýchkoli "vedlejších účinků". Pro účinný rozklad dusičnanů potřebují bakterie zdroj uhlíku (potravu), který je obsažen ve filtračním materiálu. Kuličky JBL BioNitratEX se proto postupně zmenšují, dokud nejsou zcela rozloženy. Teprve poté je třeba je vyměnit.